Data Related Infomation

Camellia sinensis var. sinensis cv. Tieguanyin                  GWHPASIV045689                   FAFU Release 1 Annotation

DNA Coding Sequence & Protein Sequence

Gene Identification

Gene Product Name:   Leucine-rich repeat
Locus Name:   GWHPASIV045689

KEGG Orthology

K13420  K13415  K13416  K00924  K13430  K04730  K20718  K13418  K04733  K08844  K16224  K13436  K13428  K04427  K13417  K13437  K13429  K08846  K13435  K18873  K08847  K05704  K04732  K04367  K08884  K08848  K05111  K13466  K04419  K04447  K08892  K04362  K20359  K08889  K16289  K08842  K02831  K05705  K08841  K08893  K14500  K05728  K21358  K04365  K05743  K05121  K04423  K11217  K19613  K06272  K04411  K04366  K08794  K08895  K02861  K08282  K05703  K08835  K13303  K13412  K08838  K04417  K20716  K20604  K20717  K07364  K12323  K08850  K08849  K05122  K05103  K05127  K07363  K05108  K02206  K06641  K08896  K20607  K17511  K06683  K08852  K11481  K04345  K05129  K12324  K08252  K05126  K22600  K13419  K08894  K13468  K21357  K04418  K01769  K05094  K05099  K08863  K13471  K13446  K05093  K08269  K20606  K08865  K02202  K04410  K12771  K07198  K06633  K23453  K08857  K05854  K11479  K04421  K11218  K02449  K04563  K03083  K04426  K04422  K16288  K20876  K05102  K04420  K04368  K04412  K08829  K13470  K08861  K04416  K07298  K06655  K08862  K08824  K11916  K08843  K13465  K07359  K08016  K04360  K04445  K19800  K04373  K08813  K08888  K11480  K12322  K08818  K05125  K13596  K05733  K02087  K13023  K02216  K20603  K04430  K19596  K13302  K08834  K17512  K05105  K08817  K08867  K13976  K05855  K17510  K12766  K14502  K08845  K12321  K17534  K17256  K02090  K20600  K04675  K08811  K12776  K05106  K13413  K05123  K08819  K12796  K04409  K08859  K17545  K06631  K00916  K06276  K08804  K18670  K04463  K11912  K17540  K05101  K14512  K17550  K02089  K00910  K05110  K07370  K20605  K04456  K20878  K05104  K13578  K08822  K04688  K20602  K05734  K05085  K05112  K05115  K16340  K12378  K16194  K22009  K08291  K08840  K16510  K10130  K11226  K18052  K08885  K20872  K05128  K13986  K11219  K07360  K05109  K03114  K13730  K05744  K20535  K08271  K17544  K11244  K08796  K08886  K08798  K13872  K12761  K05083  K06660  K08828  K04670  K08294  K19477  K00871  K23533  K20536  K11228  K20879  K04674  K05107  K04432  K04425  K05095  K05871  K02091  K16316  K05113  K05735  K04467  K18808  K06261  K04672  K08399  K13459  K15048  K18669  K24500  K06260  K04428  K07209  K04406  K20230  K04433  K19603  K08864  K23691  K08858  K16195  K10641  K04443  K08833  K13975  K05869  K08790  K08793  K11230  K18809  K16362  K08898  K20877  K04431  K06668  K05100  K05124  K17546  K16310  K05401  K07376  K06632  K04444  K04307  K04372  K18529  K11889  K05736  K02211  K08795  K17541  K00908  K15562  K04306  K04468  K04440  K16351  K20839  K06070  K14498  K20873  K05096  K08809  K10348  K17302  K08856  K00909  K07527  K12572  K04673  K18051  K18952  K10160  K08462  K20537  K04414  K08121  K18637  K08860  K24492  K21158  K04369  K19663  K20237  K05119  K19662  K02178  K08855  K16665  K16661  K22038  K04515  K20875  K23561  K08805  K21157  K04413  K08293  K04388  K05098  K08799  K08800  K22529  K08810  K04308  K04408  K02677  K19850  K18050  K20880  K08797  K06667  K16358  K08899  K13567  K05097  K08119  K17532  K17480  K16854  K06103  K18807  K08832  K19439  K08827  K08821  K06839  K04309  K16660  K05116  K08123  K05725  K06499  K24055  K10159  K04464  K08876  K17751  K17547  K06788  K05088  K16308  K08812  K05033  K04527  K08808  K11229  K13594  K15594  K18679  K19008  K14142  K20538  K04407  K19763  K18646  K08825  K16360  K08806  K05410  K17579  K08118  K06770  K13568  K20715  K08461  K02218  K08124  K06850  K20599  K13460  K05089  K08853  K08601  K06838  K08877  K16659  K08826  K08803  K08120  K16778  K17531  K22019  K08807  K13457  K05087  K16311  K05091  K08130  K08823  K22615  K16313  K06789  K16279  K08802  K08460  K15353  K06090  K05141  K10168  K05092  K05132  K15595  K08125  K04442  K16606  K08128  K04363  K04702  K15411  K05090  K02214  K08333  K16717  K18647  K10169  K10268  K07599  K18648  K18259  K08816  K06796  K05698  K21506  K05458  K05689  K16355  K06555  K06576  K04247  K10171  K18680  K06790  K17533  K24491  K20053  K16240  K17388  K16680  K22449  K08836  K19690  K06477  K11227  K19849  K06449  K05117  K06451  K06787  K07597  K23785  K06491  K06409  K24493  K16666  K05694  K03907  K20245  K18034  K16770  K11092  K14050  K16309  K16356  K16354  K14319  K15409  K16196  

Gene Family

Pkinase

Gene Attributes

No Gene Attributes Found

Gene Ontology Classification

Database Annotation Match Start Match End GO
PfamLeucine-rich repeat123182GO:0005515
PfamProtein kinase domain372632GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468
ProSiteProfilesProtein kinase domain369638GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468
ProSitePatternsProtein kinase, ATP binding site375397GO:0005524

Signal Peptide

No Signal Peptide Found

PFAM hits

Accession Annotation Match Start Match End E-value
PF13855Leucine rich repeat1231821e-5
PF00069Protein kinase domain3726321e-5
PF08263Leucine rich repeat N-terminal domain36701e-5

Interpro hits

Interpro Accession Database Match Start Match End Annotation
-SUPERFAMILY55215L domain-like
IPR001611Pfam123182Leucine rich repeat
IPR000719Pfam372632Protein kinase domain
IPR000719ProSiteProfiles369638Protein kinase domain profile.
-PANTHER16658OS05G0588300 PROTEIN
IPR013210Pfam3670Leucine rich repeat N-terminal domain
IPR032675Gene3D144269Ribonuclease Inhibitor
IPR032675Gene3D36143Ribonuclease Inhibitor
-PANTHER16658INACTIVE RECEPTOR KINASE-RELATED
-Gene3D444656Transferase(Phosphotransferase) domain 1
IPR017441ProSitePatterns375397Protein kinases ATP-binding region signature.
-CDD375638STKc_IRAK
-MobiDBLite630658consensus disorder prediction
-Gene3D340443Phosphorylase Kinase; domain 1
IPR011009SUPERFAMILY373642Protein kinase-like (PK-like)

Gene Structure

Blastn Searches(aligned nr database from NCBI)

Accession(nr database) %Identity Length E-value
NullNullNullNull