Data Related Infomation

Camellia sinensis var. sinensis cv. Tieguanyin                  GWHPASIV001616                   FAFU Release 1 Annotation

DNA Coding Sequence & Protein Sequence

Gene Identification

Gene Product Name:   S-locus glycoprotein domain
Locus Name:   GWHPASIV001616

KEGG Orthology

K13430  K13416  K13415  K13418  K13420  K00924  K04730  K20718  K13417  K18873  K04733  K16224  K13436  K13435  K13429  K04427  K13428  K13437  K08844  K04732  K08884  K08846  K04367  K14500  K05111  K08892  K05704  K08847  K04419  K04447  K16289  K08889  K02861  K08842  K02831  K05703  K05743  K08794  K05121  K05126  K11217  K05705  K08895  K20607  K05728  K04362  K04365  K08850  K21358  K08852  K08848  K07198  K05108  K06641  K13303  K08863  K04420  K08841  K08269  K04423  K08282  K04345  K08893  K05103  K04467  K17511  K04366  K04411  K02216  K05105  K20604  K20872  K04417  K08294  K06633  K08252  K11916  K08857  K05122  K05129  K08894  K05093  K04422  K13419  K17512  K20876  K08896  K20717  K05106  K05087  K05099  K02206  K04368  K11481  K04360  K13412  K08838  K06655  K05855  K07363  K08849  K02202  K06276  K05102  K04410  K05110  K08829  K05104  K20606  K11479  K07364  K19800  K11218  K07359  K20716  K04421  K20879  K05854  K20605  K08861  K12324  K21357  K07209  K16288  K08813  K16195  K02087  K13596  K03114  K08859  K12761  K13302  K07298  K08835  K05112  K11226  K20603  K08845  K04672  K08843  K07376  K05101  K08862  K06683  K07527  K05115  K17534  K23453  K04418  K13872  K08828  K06631  K08864  K04373  K19477  K08888  K08817  K08824  K04430  K08798  K22600  K04527  K05107  K04670  K08811  K04412  K06660  K05125  K04688  K06272  K08016  K12771  K20877  K08865  K16310  K08856  K11912  K05085  K08886  K08291  K05094  K05109  K12776  K12323  K06070  K04563  K11480  K05113  K07370  K05733  K05871  K05127  K05119  K02089  K04409  K04463  K17545  K08885  K13413  K05100  K06632  K04432  K08867  K05869  K08799  K18670  K16196  K11219  K06668  K16194  K04416  K18529  K20602  K16510  K05744  K20878  K08806  K13578  K01769  K04426  K04445  K17510  K12322  K11230  K04433  K03083  K05083  K04673  K07360  K08805  K02090  K04675  K00910  K00871  K17544  K00909  K05095  K15048  K08818  K05123  K13976  K20359  K19596  K08796  K05410  K18952  K08804  K08834  K05117  K05088  K00908  K05725  K20875  K20880  K11228  K04702  K04456  K08795  K20600  K08860  K18669  K05124  K08793  K17302  K08807  K02449  K04674  K08840  K12378  K18051  K14498  K05734  K02091  K04468  K08808  K05086  K05128  K08855  K08800  K04431  K14502  K14512  K08899  K19663  K04515  K19662  K04369  K08819  K23691  K18052  K20535  K11889  K20873  K08790  K08810  K15486  K19603  K08802  K20536  K08822  K15562  K20537  K02211  K04428  K00916  K17530  K05098  K11715  K04440  K05118  K05735  K04372  K05116  K08830  K08809  K05096  K13986  K16308  K05736  K17480  K17547  K05097  K05090  K04425  K05091  K14758  K08293  K17540  K08827  K19763  K08803  K06855  K11227  K19008  K04413  K02677  K06667  K18050  K13975  K04407  K12766  K08853  K17541  K04464  K04406  K05092  K17546  K08797  K04408  K05089  K08271  K23561  K02218  K16311  K04388  K21157  K05033  K12321  K08821  K06103  K22009  K15595  K03097  K17388  K11229  K08832  K21158  K08833  K13567  K08854  K08898  K15409  K15594  K18679  K08959  K04414  K08826  K08825  K19439  K16316  K23785  K08831  K14958  K08957  K06069  K07211  K08877  K13594  K19847  K02208  K12765  K08823  K08801  K17751  K08858  K13568  K15596  K19009  K08836  K16313  K02178  K17533  K08866  K04363  K04443  K16309  K20538  K08960  K01412  K05688  K12767  K20714  K04514  K08788  K17531  K06684  K04442  K04444  K06686  K20839  K20715  K16279  K08958  K17532  K16312  K08816  K08812  K16307  K02214  K24471  K01165  

Gene Family

Pkinase

Gene Attributes

No Gene Attributes Found

Gene Ontology Classification

Database Annotation Match Start Match End GO
PfamS-locus glycoprotein domain251332GO:0048544
ProSitePatternsSerine/threonine-protein kinase, active site645657GO:0004672|GO:0006468
SMARTProtein kinase domain522794GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468
ProSitePatternsProtein kinase, ATP binding site528551GO:0005524
PIRSFS-receptor-like serine/threonine-protein kinase1850GO:0004674
ProSiteProfilesProtein kinase domain522798GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468
PfamProtein kinase domain526791GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468

Signal Peptide

No Signal Peptide Found

PFAM hits

Accession Annotation Match Start Match End E-value
PF00954S-locus glycoprotein domain2513321e-5
PF00069Protein kinase domain5267911e-5
PF01453D-mannose binding lectin801651e-5

Interpro hits

Interpro Accession Database Match Start Match End Annotation
IPR000858Pfam251332S-locus glycoprotein domain
-Gene3D486597Phosphorylase Kinase; domain 1
IPR001480CDD43152B_lectin
IPR008271ProSitePatterns645657Serine/Threonine protein kinases active-site signature.
-PANTHER7856OS07G0415500 PROTEIN
IPR001480ProSiteProfiles32150Bulb-type lectin domain profile.
IPR000719SMART522794serkin_6
-PANTHER7856G-TYPE LECTIN S-RECEPTOR-LIKE SERINE/THREONINE-KINASE PLANT
IPR017441ProSitePatterns528551Protein kinases ATP-binding region signature.
IPR024171PIRSF1850SRK
IPR011009SUPERFAMILY503795Protein kinase-like (PK-like)
IPR000719ProSiteProfiles522798Protein kinase domain profile.
IPR001480SMART33152blect_4
IPR000719Pfam526791Protein kinase domain
IPR001480Pfam80165D-mannose binding lectin
-Gene3D598802Transferase(Phosphotransferase) domain 1
IPR036426Gene3D33151Agglutinin
IPR036426SUPERFAMILY81167alpha-D-mannose-specific plant lectins

Gene Structure

Blastn Searches(aligned nr database from NCBI)

Accession(nr database) %Identity Length E-value
NullNullNullNull