Data Related Infomation

Camellia sinensis var. sinensis cv. Tieguanyin                  GWHPASIV007453                   FAFU Release 1 Annotation

DNA Coding Sequence & Protein Sequence

Gene Identification

Gene Product Name:   No Gene Product Found
Locus Name:   

KEGG Orthology

K01904  K10526  K01897  K18687  K02182  K18661  K12507  K23617  K05914  K02363  K22149  K01895  K22133  K12238  K03367  K08295  K15868  K12424  K18660  K15670  K04787  K04783  K20034  K01911  K04105  K01896  K14760  K22319  K18688  K15661  K15654  K15667  K15656  K04789  K01909  K15665  K04110  K23618  K20423  K15013  K15664  K12429  K15655  K04788  K02364  K21780  K16029  K15668  K14467  K14466  K16375  K12428  K12426  K01908  K21284  K09460  K04784  K01913  K12240  K16123  K15666  K04792  K23875  K24408  K00142  K13611  K12709  K15663  K16094  K12239  K16124  K08749  K16392  K15394  K16095  K16093  K12423  K24101  K23108  K16122  K21225  K16116  K08745  K15653  K24110  K22118  K16132  K16131  K12421  K00155  K15659  K15395  K15675  K16120  K16099  K15646  K16097  K19103  K22148  K12422  K22798  K12427  K22152  K16126  K12444  K16119  K16429  K13776  K16121  K16108  K16378  K16430  K21107  K12701  K14417  K19102  K16127  K01907  K16125  K16416  K12237  K16130  K12913  K15384  K12743  K01043  K14312  K16106  K12442  K16117  K18000  K16395  K08748  K12719  K23631  K03822  K15658  K22581  K23667  K16228  K16229  K16112  K23665  K15391  K00143  K08772  K16109  K16098  K12912  K21182  K18281  K23627  K22739  K16102  K23888  K22369  K12911  K21792  K16111  K21228  K01912  K16432  K23646  K16101  K16113  K03342  

Gene Family

AMP-binding

Gene Attributes

No Gene Attributes Found

Gene Ontology Classification

Database Annotation Match Start Match End GO
NullNullNullNullNull

Signal Peptide

No Signal Peptide Found

PFAM hits

Accession Annotation Match Start Match End E-value
PF00501AMP-binding enzyme334431e-5
PF13193AMP-binding enzyme C-terminal domain4525271e-5

Interpro hits

Interpro Accession Database Match Start Match End Annotation
-CDD215334CL
-SUPERFAMILY10539Acetyl-CoA synthetase-like
IPR042099Gene3D1437-
IPR020845ProSitePatterns187198Putative AMP-binding domain signature.
IPR000873Pfam33443AMP-binding enzyme
IPR025110Pfam452527AMP-binding enzyme C-terminal domain
-PANTHER65384-COUMARATE--COA LIGASE 2-LIKE
-PANTHER6538LONG-CHAIN-FATTY-ACID--COA LIGASE
-Gene3D438540-

Gene Structure

Blastn Searches(aligned nr database from NCBI)

Accession(nr database) %Identity Length E-value
NullNullNullNull