Camellia sinensis var. sinensis cv. Tieguanyin                  GWHPASIV013627                   FAFU Release 1 Annotation

Click here download sequences in FASTA format.

Gene Product Name:	Leucine-rich repeat
Locus Name:	GWHPASIV013627

K13420  K13415  K13416  K20718  K00924  K13417  K13430  K13428  K04730  K13418  K13436  K16224  K08844  K04427  K04733  K13437  K13429  K13435  K04732  K04362  K05111  K13466  K08884  K05121  K20359  K18873  K05704  K04367  K08842  K04419  K04447  K05743  K08794  K08889  K08892  K08846  K05126  K02831  K13303  K08852  K05122  K06272  K08841  K13412  K05129  K05093  K08847  K04373  K05705  K02861  K04365  K08282  K04366  K13465  K05103  K14500  K08857  K04417  K19613  K05108  K04411  K21358  K08252  K04445  K08865  K08838  K08896  K04345  K02206  K13419  K11217  K20604  K08850  K08893  K08895  K05728  K08848  K13446  K05703  K05094  K20603  K08849  K13470  K04418  K08856  K08829  K05127  K11916  K13468  K11481  K06641  K20716  K13471  K17510  K05105  K12378  K16289  K21357  K13302  K05106  K20607  K06633  K16288  K11479  K20717  K07364  K05099  K05854  K17545  K17511  K08269  K13596  K08835  K08834  K20876  K07363  K04360  K05125  K04563  K08863  K03083  K04410  K07298  K04688  K19800  K04368  K07198  K05102  K17256  K05744  K08894  K04412  K08818  K06655  K05123  K23453  K08861  K08845  K02202  K05104  K11480  K22600  K08862  K02449  K05112  K06276  K08813  K17534  K04423  K18052  K16510  K12323  K02216  K12771  K05733  K08271  K08291  K19477  K04426  K05734  K04456  K08888  K08811  K03114  K19596  K13023  K01769  K05110  K13976  K12322  K13413  K11218  K22009  K20536  K08840  K02087  K14512  K08843  K08016  K04421  K06683  K17540  K14502  K20872  K13578  K08898  K06632  K20600  K04674  K12776  K12761  K19662  K08822  K20879  K05128  K04409  K12766  K20602  K05095  K18051  K13459  K07359  K04463  K05109  K05115  K17550  K04675  K02090  K20878  K08828  K12324  K17512  K06631  K04422  K20873  K11226  K20606  K05101  K18808  K04673  K05735  K05113  K18952  K00910  K04388  K04430  K02089  K05869  K12321  K08804  K08796  K07527  K20877  K08795  K10159  K04670  K00871  K08819  K05107  K16194  K20605  K17544  K20535  K04372  K11912  K07209  K05855  K05124  K04432  K08824  K10130  K04672  K20839  K05871  K08817  K08790  K04420  K13730  K20875  K08859  K22038  K00909  K18809  K05119  K04467  K23533  K05736  K08294  K19663  K10348  K08399  K02677  K04307  K05401  K05087  K06668  K11228  K08121  K12796  K06660  K11219  K17546  K05083  K03097  K08858  K04416  K16340  K05085  K08867  K15048  K13872  K08805  K16196  K16316  K08808  K08798  K06261  K18669  K14498  K04515  K05097  K11230  K23691  K02178  K08899  K07360  K05100  K07370  K04433  K04414  K08885  K02091  K20537  K18050  K07376  K04443  K10169  K20599  K13567  K20880  K16310  K04369  K04406  K17533  K04308  K04440  K05096  K17302  K17541  K10168  K08833  K20538  K19603  K16665  K16362  K04527  K13986  K10160  K08886  K20714  K24493  K13594  K18637  K04425  K24500  K02211  K20715  K17547  K10641  K05116  K08810  K24095  K06667  K04306  K16195  K17532  K11244  K22529  K04444  K16358  K02208  K18529  K23561  K17751  K16351  K08827  K08799  K08124  K04413  K15562  K06260  K17388  K06855  K02214  K14142  K04468  K04464  K08125  K16666  K18670  K16355  K08807  K11889  K18679  K05033  K17543  K04407  K08832  K05098  K08860  K05089  K08293  K24492  K04391  K16308  K13460  K08800  K08806  K15069  K06103  K11227  K13975  K17480  K19439  K08797  K00908  K08793  K05088  K05725  K16279  K05141  K08462  K16606  K13568  K20230  K06555  K08821  K08123  K16357  K04428  K19763  K05410  K17530  K19008  K16661  K00916  K21158  K04309  K16313  K10171  K06686  K08120  K06090  K04408  K13457  K16240  K08876  K08812  K08118  K08130  K06786  K11229  K08814  K19690  K08823  K14050  K16717  K05146  K06449  K08851  K14758  K06838  K16680  K08864  K14319  K19902  K19850  K08119  K10268  K04363  K06477  K16336  K24471  K18648  K05091  K06790  K19908  K17528  K16660  K07211  K06070  K03907  K15353  K07599  K06839  K18807  K08802  K16309  K24399  K08825  K06732  K24055  K06491  K08128  K00057  K08877  K06578  K20237  K06592  K06069  K16354  K06820  K04431  K06788  K24491  K05086  K17531  K05060  K05092  K22449  K22615  K05117  K18646  K05090  K04985  K18647  K08601  K16360  K23785  K14284  K17579  K12767  K16356  K18461  K19750  

Pkinase

No Gene Attributes Found

Database	Annotation	Match Start	Match End	GO
Pfam	Leucine-rich repeat	166	188	GO:0005515
Pfam	Leucine-rich repeat	212	234	GO:0005515
ProSitePatterns	Protein kinase, ATP binding site	369	400	GO:0005524
Pfam	Protein kinase domain	366	629	GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468
ProSiteProfiles	Protein kinase domain	363	650	GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468

No Signal Peptide Found

Accession	Annotation	Match Start	Match End	E-value
PF00560	Leucine Rich Repeat	166	188	1e-5
PF00560	Leucine Rich Repeat	212	234	1e-5
PF08263	Leucine rich repeat N-terminal domain	53	90	1e-5
PF00069	Protein kinase domain	366	629	1e-5

Interpro Accession	Database	Match Start	Match End	Annotation
-	Gene3D	332	438	Phosphorylase Kinase; domain 1
-	MobiDBLite	316	336	consensus disorder prediction
-	PANTHER	21	649	LRR RECEPTOR-LIKE KINASE
-	PANTHER	21	649	OS05G0588300 PROTEIN
-	CDD	369	634	STKc_IRAK
IPR032675	Gene3D	209	254	Ribonuclease Inhibitor
IPR001611	Pfam	166	188	Leucine Rich Repeat
IPR001611	Pfam	212	234	Leucine Rich Repeat
IPR013210	Pfam	53	90	Leucine rich repeat N-terminal domain
IPR011009	SUPERFAMILY	367	640	Protein kinase-like (PK-like)
IPR017441	ProSitePatterns	369	400	Protein kinases ATP-binding region signature.
-	Gene3D	439	650	Transferase(Phosphotransferase) domain 1
IPR032675	Gene3D	48	208	Ribonuclease Inhibitor
IPR000719	Pfam	366	629	Protein kinase domain
IPR000719	ProSiteProfiles	363	650	Protein kinase domain profile.
-	SUPERFAMILY	65	253	L domain-like

Accession(nr database)	%Identity	Length	E-value
Null	Null	Null	Null