Camellia sinensis var. sinensis cv. Tieguanyin                  GWHPASIV019146                   FAFU Release 1 Annotation

Click here download sequences in FASTA format.

Gene Product Name:	Leucine-rich repeat
Locus Name:	GWHPASIV019146

K13420  K13415  K13416  K00924  K20718  K13430  K16224  K08844  K13428  K04730  K13437  K04733  K13418  K13436  K04427  K13429  K13417  K13466  K18873  K13435  K04732  K19613  K13465  K08847  K08846  K04367  K05111  K05704  K08842  K04447  K04419  K05743  K08884  K04362  K08889  K05121  K11217  K13468  K14500  K06272  K08841  K04423  K21358  K13471  K05103  K05099  K08849  K05129  K08865  K08848  K20359  K08794  K08282  K05108  K12324  K02861  K08843  K05126  K13730  K05728  K08838  K12323  K04417  K16289  K05122  K13446  K05102  K13470  K08252  K20604  K08894  K05705  K06633  K17256  K13023  K01769  K12796  K17550  K04422  K08895  K17510  K12322  K05093  K05703  K13412  K22600  K04418  K04366  K05094  K16340  K07363  K11916  K13303  K11218  K02831  K05125  K02206  K04345  K08857  K06641  K08829  K08850  K04365  K04360  K04411  K20876  K08399  K08835  K08892  K18808  K16288  K17512  K08885  K16351  K05123  K05105  K04445  K11481  K04368  K17544  K05127  K08852  K08893  K07364  K12771  K02449  K02202  K12776  K20607  K17511  K10130  K11479  K16194  K05401  K05855  K21357  K12321  K05115  K08896  K07198  K07298  K11219  K18809  K22038  K08863  K05106  K17534  K04421  K04307  K04373  K04563  K13596  K04463  K20600  K03083  K20878  K07359  K13419  K08813  K20717  K13459  K05744  K08269  K04420  K04670  K02087  K23533  K08822  K20603  K20716  K20606  K16665  K20602  K11480  K08804  K08859  K05112  K04430  K06260  K04675  K05104  K07360  K24492  K13976  K22009  K16316  K04426  K16358  K06683  K13578  K12378  K05128  K08888  K00871  K08016  K23453  K08861  K17546  K12766  K08811  K08294  K08886  K08834  K06655  K04410  K13413  K04309  K04674  K08845  K16510  K11912  K02216  K04433  K13302  K05100  K10641  K20535  K08818  K14512  K08828  K06261  K04388  K04306  K04432  K05101  K05107  K16355  K08856  K05109  K18669  K08121  K13457  K10160  K20879  K08867  K07527  K18529  K05869  K07370  K02089  K13872  K04467  K17540  K08795  K04412  K16195  K05095  K04308  K20877  K20872  K06838  K20873  K20230  K08862  K17545  K10169  K11244  K08271  K05854  K10159  K05734  K22529  K08860  K24055  K23561  K20536  K06668  K24500  K08796  K19477  K11226  K10348  K05124  K04369  K00908  K04443  K05110  K08824  K06839  K05733  K20237  K06555  K14142  K02090  K15048  K24095  K12761  K04673  K04672  K06276  K14502  K18807  K08123  K05116  K11228  K16360  K05119  K04688  K04456  K20599  K05113  K04247  K16661  K08119  K21158  K20537  K18052  K05871  K20875  K20839  K18670  K17541  K04468  K15069  K16362  K08462  K08798  K10168  K05087  K16196  K05085  K04431  K08810  K06070  K08124  K02091  K03114  K04444  K20880  K16666  K04416  K16717  K22615  K04406  K07209  K16606  K16310  K13567  K08460  K08130  K16240  K08118  K11889  K18637  K08819  K19800  K16354  K08840  K18952  K04372  K08120  K18648  K17579  K08830  K02211  K15486  K06103  K13975  K17480  K20605  K08793  K04985  K17302  K05117  K06631  K08790  K24493  K08877  K04440  K10171  K08899  K06850  K05096  K16357  K08864  K06632  K19663  K05735  K15562  K00910  K04249  K14498  K13568  K06667  K05083  K16659  K08125  K06788  K17547  K08812  K06499  K08601  K08805  K19763  K20714  K18679  K08127  K04527  K06770  K18646  K00909  K13453  K19008  K05097  K07376  K19596  K08823  K06660  K08803  K22449  K04409  K19850  K08291  K08809  K07988  K19439  K14050  K19662  K06776  K08461  K08832  K06737  K13594  K16356  K08808  K08833  K04515  K16660  K00916  K05098  K18259  K17532  K06576  K13460  K12805  K08128  K08825  K06787  K05086  K18647  K08514  K02178  K08898  K02214  K06263  K16680  K08799  K05089  K02677  K06789  K11230  K07992  K05736  K06449  K05698  K04414  K23608  K22655  K17568  K21506  K07156  K18051  K16279  K15068  K16825  K06765  K08855  K14958  K19914  K18034  K04391  K16498  K07211  K04408  K17531  K24491  K04363  K03907  K05091  K16308  K05694  K05092  K19999  K19690  K06262  K14319  K08333  K05088  K17567  K23785  K16532  K11092  K15353  K19750  K08060  K14284  K16770  K17576  

Pkinase_Tyr

No Gene Attributes Found

Database	Annotation	Match Start	Match End	GO
ProSiteProfiles	Leucine-rich repeat	162	184	GO:0005515
ProSiteProfiles	Leucine-rich repeat	185	208	GO:0005515
ProSiteProfiles	Protein kinase domain	325	596	GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468
ProSiteProfiles	Leucine-rich repeat	114	136	GO:0005515
ProSiteProfiles	Leucine-rich repeat	138	161	GO:0005515
ProSiteProfiles	Leucine-rich repeat	90	111	GO:0005515
Pfam	Serine-threonine/tyrosine-protein kinase, catalytic domain	329	592	GO:0004672|GO:0006468

No Signal Peptide Found

Accession	Annotation	Match Start	Match End	E-value
PF08263	Leucine rich repeat N-terminal domain	24	60	1e-5
PF07714	Protein tyrosine and serine/threonine kinase	329	592	1e-5

Interpro Accession	Database	Match Start	Match End	Annotation
-	SUPERFAMILY	31	211	L domain-like
IPR001611	ProSiteProfiles	162	184	Leucine-rich repeat profile.
-	Gene3D	403	598	Transferase(Phosphotransferase) domain 1
IPR011009	SUPERFAMILY	329	594	Protein kinase-like (PK-like)
IPR001611	ProSiteProfiles	185	208	Leucine-rich repeat profile.
IPR000719	ProSiteProfiles	325	596	Protein kinase domain profile.
IPR001611	ProSiteProfiles	114	136	Leucine-rich repeat profile.
IPR032675	Gene3D	181	231	Ribonuclease Inhibitor
IPR001611	ProSiteProfiles	138	161	Leucine-rich repeat profile.
IPR001611	ProSiteProfiles	90	111	Leucine-rich repeat profile.
IPR013210	Pfam	24	60	Leucine rich repeat N-terminal domain
IPR032675	Gene3D	19	180	Ribonuclease Inhibitor
-	PANTHER	9	597	OS05G0588300 PROTEIN
IPR001245	Pfam	329	592	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
-	Gene3D	295	402	Phosphorylase Kinase; domain 1
-	PANTHER	9	597	LRR RECEPTOR-LIKE KINASE

Accession(nr database)	%Identity	Length	E-value
Null	Null	Null	Null