Data Related Infomation

Camellia sinensis var. sinensis cv. Tieguanyin                  GWHPASIV032752                   FAFU Release 1 Annotation

DNA Coding Sequence & Protein Sequence

Gene Identification

Gene Product Name:   S-locus glycoprotein domain
Locus Name:   GWHPASIV032752

KEGG Orthology

K13430  K13415  K13416  K00924  K13420  K04730  K13418  K20718  K13417  K13436  K16224  K04733  K13429  K04427  K18873  K13435  K13428  K04732  K08844  K08884  K14500  K08847  K04367  K05111  K08846  K05704  K04447  K04419  K08892  K05728  K08889  K02861  K08282  K02216  K11217  K05703  K05705  K08842  K21358  K16289  K02831  K08269  K04417  K08848  K05743  K08849  K04365  K08838  K08895  K05108  K05103  K13437  K08841  K20607  K08252  K08794  K11916  K05126  K06683  K04360  K13419  K07363  K20604  K04362  K08850  K08896  K06641  K08852  K04423  K04421  K17511  K13412  K07364  K20717  K04420  K04411  K05105  K07198  K11481  K05121  K07359  K17512  K04368  K08835  K08893  K05129  K13303  K11912  K06633  K04366  K04345  K05122  K05099  K05102  K20603  K17534  K05106  K05104  K05855  K05125  K02202  K21357  K08843  K22600  K05110  K05101  K12323  K20606  K04422  K02206  K20716  K12324  K08894  K08863  K05107  K03114  K08865  K06655  K04463  K12771  K11479  K08857  K05109  K13872  K05112  K08798  K05093  K20876  K08016  K06272  K13413  K04418  K08829  K04430  K07298  K11226  K04410  K05124  K02087  K08864  K04412  K04527  K19800  K05854  K08888  K23453  K13596  K08861  K16195  K20872  K04467  K08859  K04670  K12761  K06668  K08818  K04373  K04563  K07370  K08294  K07527  K08811  K08845  K11480  K08813  K20877  K06276  K08856  K17545  K11219  K11218  K05087  K13976  K13302  K08834  K08796  K05113  K08828  K05127  K03083  K07209  K00908  K05733  K06631  K02090  K12776  K20879  K08840  K05128  K05119  K08817  K16288  K02449  K18670  K02089  K08886  K08819  K04416  K20605  K20878  K02091  K04672  K08824  K18529  K11228  K16194  K05123  K08862  K05115  K04426  K19477  K13578  K05094  K08799  K20602  K00871  K04445  K14512  K04673  K05100  K20600  K05869  K04674  K12322  K05088  K05871  K14502  K20880  K11230  K04433  K04432  K06632  K04688  K00916  K01769  K16310  K08802  K08822  K04675  K06660  K05734  K04431  K07360  K04428  K18669  K08867  K17510  K08885  K11227  K05095  K05744  K12766  K20535  K16196  K00910  K04409  K14498  K20875  K07376  K15048  K04369  K08821  K12378  K04515  K20537  K20536  K05085  K16510  K19596  K13975  K08795  K08793  K05410  K08291  K20873  K20359  K17302  K08804  K18052  K08898  K06070  K08806  K02211  K08860  K08899  K08790  K06667  K11889  K17388  K17547  K04702  K05725  K03097  K18952  K19008  K15595  K02218  K18051  K22009  K14758  K05086  K17544  K12321  K15562  K06855  K08825  K08805  K08271  K08808  K08800  K19763  K13986  K08807  K04468  K04406  K19603  K15594  K05117  K04456  K08877  K05083  K05736  K08809  K08827  K11229  K05118  K05735  K04388  K19662  K04407  K02208  K21157  K13567  K17480  K04372  K04413  K23785  K18680  K04514  K04425  K15486  K08833  K18679  K13594  K19663  K02214  K08810  K17546  K18050  K08855  K16311  K08858  K13568  K07211  K15596  K04464  K08797  K04414  K19009  K11715  K17541  K19847  K14958  K08830  K17530  K20839  K16308  K20538  K04440  K00909  K08957  K08959  K08826  K08803  K04408  K17540  K17751  K17531  K23691  K23561  K05033  K06103  K01165  K16316  K12765  K08960  K20715  K05096  K08293  K04443  K02677  K08866  K05089  K21158  K08853  K05091  K05098  K05116  K06069  K08832  K05097  K16313  K17532  K16309  K20714  K17548  K01412  K19439  K15409  K02178  K06686  K04444  K05092  K08836  K19690  K06684  K04442  K08869  K05090  K08788  K08831  K12767  K08823  K04363  K08789  K17533  K16279  K16307  

Gene Family

Pkinase

Gene Attributes

No Gene Attributes Found

Gene Ontology Classification

Database Annotation Match Start Match End GO
PfamS-locus glycoprotein domain255316GO:0048544
ProSitePatternsProtein kinase, ATP binding site530552GO:0005524
ProSiteProfilesProtein kinase domain524804GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468
PfamProtein kinase domain526793GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468
PIRSFS-receptor-like serine/threonine-protein kinase1808GO:0004674
ProSitePatternsSerine/threonine-protein kinase, active site644656GO:0004672|GO:0006468
SMARTProtein kinase domain524797GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468

Signal Peptide

No Signal Peptide Found

PFAM hits

Accession Annotation Match Start Match End E-value
PF00954S-locus glycoprotein domain2553161e-5
PF01453D-mannose binding lectin781671e-5
PF00069Protein kinase domain5267931e-5

Interpro hits

Interpro Accession Database Match Start Match End Annotation
IPR001480ProSiteProfiles22150Bulb-type lectin domain profile.
IPR000858Pfam255316S-locus glycoprotein domain
-PANTHER9804G-TYPE LECTIN S-RECEPTOR-LIKE SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE SD2-5
-PANTHER9804LECTIN PROTEIN KINASE FAMILY PROTEIN, PUTATIVE-RELATED
IPR001480SMART37152blect_4
IPR036426Gene3D31150Agglutinin
IPR003609ProSiteProfiles335410PAN/Apple domain profile.
IPR036426SUPERFAMILY65208alpha-D-mannose-specific plant lectins
IPR017441ProSitePatterns530552Protein kinases ATP-binding region signature.
-Gene3D599810Transferase(Phosphotransferase) domain 1
IPR000719ProSiteProfiles524804Protein kinase domain profile.
IPR001480Pfam78167D-mannose binding lectin
-CDD530797STKc_IRAK
IPR000719Pfam526793Protein kinase domain
-Gene3D490598Phosphorylase Kinase; domain 1
IPR024171PIRSF1808SRK
IPR008271ProSitePatterns644656Serine/Threonine protein kinases active-site signature.
IPR000742ProSiteProfiles285321EGF-like domain profile.
IPR011009SUPERFAMILY507797Protein kinase-like (PK-like)
-CDD331417PAN_AP_plant
IPR000719SMART524797serkin_6
IPR001480CDD45152B_lectin

Gene Structure

Blastn Searches(aligned nr database from NCBI)

Accession(nr database) %Identity Length E-value
NullNullNullNull